Diceritakan dalam game ini bahwa Uni Soviet memimpin negara-negara komunis yang ada di seluruh dunia. Mereka kemudian melakukan invasi dengan menduduki beberapa kota besar di Amerika Serikat. Di sini, para pemain akan mengendalikan seorang pria bernama Christopher Stone. Ia memimpin kelompok pemberontak untuk berperang melawan pasukan penjajah.

Freedom Fighters menawarkan mekanisme third person shooter dengan para pemain dapat menjelajahi map untuk berperang melawan pasukan Uni Soviet. Di setiap misinya, pemain bisa mendapatkan skuad yang bisa direkrut. Mereka pun dapat dikontrol dengan memberikan perintah sederhana, seperti menyerang dan bertahan.

Untuk mendapatkan skuad yang lebih banyak, para pemain diharuskan mengumpulkan charisma point. Poin tersebut dapat didapatkan lewat beragam cara, seperti menghancurkan markas musuh, menyelamatkan warga sipil, dan beragam tindakan lainnya.